Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms