Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC21.31■■□□□ 1
AFDNP55196 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AFDNP55196 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC21.31■■□□□ 1
AFDNP55196 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AFDNP55196 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AFDNP55196 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AFDNP55196 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AFDNP55196 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AFDNP55196 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
AFDNP55196 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AFDNP55196 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
AFDNP55196 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AFDNP55196 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AFDNP55196 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AFDNP55196 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AFDNP55196 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AFDNP55196 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AFDNP55196 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AFDNP55196 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AFDNP55196 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AFDNP55196 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AFDNP55196 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC21.3■■□□□ 1
AFDNP55196 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AFDNP55196 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AFDNP55196 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AFDNP55196 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AFDNP55196 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AFDNP55196 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AFDNP55196 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AFDNP55196 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
AFDNP55196 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AFDNP55196 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AFDNP55196 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AFDNP55196 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AFDNP55196 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AFDNP55196 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AFDNP55196 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AFDNP55196 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AFDNP55196 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AFDNP55196 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AFDNP55196 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AFDNP55196 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AFDNP55196 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AFDNP55196 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AFDNP55196 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AFDNP55196 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AFDNP55196 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AFDNP55196 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AFDNP55196 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC21.29■■□□□ 1
AFDNP55196 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC21.29■■□□□ 1
AFDNP55196 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
AFDNP55196 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
AFDNP55196 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC21.29■■□□□ 1
AFDNP55196 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC21.29■■□□□ 1
AFDNP55196 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AFDNP55196 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AFDNP55196 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AFDNP55196 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AFDNP55196 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AFDNP55196 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AFDNP55196 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
AFDNP55196 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AFDNP55196 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AFDNP55196 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AFDNP55196 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AFDNP55196 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AFDNP55196 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
AFDNP55196 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AFDNP55196 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AFDNP55196 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AFDNP55196 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AFDNP55196 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AFDNP55196 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AFDNP55196 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AFDNP55196 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AFDNP55196 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AFDNP55196 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AFDNP55196 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AFDNP55196 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AFDNP55196 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AFDNP55196 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AFDNP55196 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC21.27■■□□□ 1
AFDNP55196 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
AFDNP55196 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
AFDNP55196 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AFDNP55196 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
AFDNP55196 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
AFDNP55196 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AFDNP55196 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AFDNP55196 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AFDNP55196 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AFDNP55196 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AFDNP55196 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AFDNP55196 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AFDNP55196 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AFDNP55196 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AFDNP55196 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AFDNP55196 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AFDNP55196 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AFDNP55196 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms