Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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HOXA5P20719 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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HOXA5P20719 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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HOXA5P20719 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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HOXA5P20719 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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HOXA5P20719 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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HOXA5P20719 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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HOXA5P20719 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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HOXA5P20719 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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HOXA5P20719 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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HOXA5P20719 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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