Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms