Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms