Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF185Q96GF1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF185Q96GF1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF185Q96GF1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF185Q96GF1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF185Q96GF1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RNF185Q96GF1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF185Q96GF1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF185Q96GF1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF185Q96GF1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF185Q96GF1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF185Q96GF1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF185Q96GF1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF185Q96GF1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF185Q96GF1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF185Q96GF1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF185Q96GF1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
RNF185Q96GF1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF185Q96GF1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF185Q96GF1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF185Q96GF1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF185Q96GF1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF185Q96GF1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RNF185Q96GF1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF185Q96GF1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF185Q96GF1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF185Q96GF1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF185Q96GF1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF185Q96GF1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF185Q96GF1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF185Q96GF1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF185Q96GF1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF185Q96GF1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF185Q96GF1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF185Q96GF1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF185Q96GF1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF185Q96GF1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF185Q96GF1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF185Q96GF1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF185Q96GF1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF185Q96GF1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF185Q96GF1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF185Q96GF1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF185Q96GF1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF185Q96GF1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF185Q96GF1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF185Q96GF1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF185Q96GF1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF185Q96GF1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF185Q96GF1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF185Q96GF1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF185Q96GF1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF185Q96GF1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF185Q96GF1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF185Q96GF1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF185Q96GF1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF185Q96GF1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF185Q96GF1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF185Q96GF1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF185Q96GF1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF185Q96GF1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF185Q96GF1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF185Q96GF1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF185Q96GF1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF185Q96GF1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF185Q96GF1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF185Q96GF1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF185Q96GF1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF185Q96GF1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF185Q96GF1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF185Q96GF1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF185Q96GF1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF185Q96GF1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF185Q96GF1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF185Q96GF1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF185Q96GF1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF185Q96GF1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF185Q96GF1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF185Q96GF1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF185Q96GF1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF185Q96GF1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF185Q96GF1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF185Q96GF1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF185Q96GF1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF185Q96GF1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF185Q96GF1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF185Q96GF1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RNF185Q96GF1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF185Q96GF1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF185Q96GF1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF185Q96GF1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF185Q96GF1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF185Q96GF1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF185Q96GF1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RNF185Q96GF1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RNF185Q96GF1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RNF185Q96GF1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RNF185Q96GF1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNF185Q96GF1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF185Q96GF1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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