Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV1P50549 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV1P50549 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV1P50549 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV1P50549 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV1P50549 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV1P50549 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV1P50549 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV1P50549 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV1P50549 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV1P50549 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV1P50549 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV1P50549 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV1P50549 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV1P50549 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV1P50549 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV1P50549 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV1P50549 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV1P50549 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV1P50549 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV1P50549 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV1P50549 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV1P50549 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV1P50549 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETV1P50549 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETV1P50549 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETV1P50549 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETV1P50549 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETV1P50549 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETV1P50549 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETV1P50549 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETV1P50549 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETV1P50549 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETV1P50549 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETV1P50549 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETV1P50549 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETV1P50549 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETV1P50549 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETV1P50549 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETV1P50549 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETV1P50549 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETV1P50549 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETV1P50549 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETV1P50549 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETV1P50549 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ETV1P50549 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETV1P50549 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ETV1P50549 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ETV1P50549 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETV1P50549 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETV1P50549 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETV1P50549 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ETV1P50549 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETV1P50549 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETV1P50549 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETV1P50549 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETV1P50549 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETV1P50549 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETV1P50549 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETV1P50549 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETV1P50549 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETV1P50549 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETV1P50549 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETV1P50549 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETV1P50549 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETV1P50549 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETV1P50549 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ETV1P50549 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ETV1P50549 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ETV1P50549 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ETV1P50549 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ETV1P50549 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ETV1P50549 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ETV1P50549 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ETV1P50549 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ETV1P50549 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ETV1P50549 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ETV1P50549 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ETV1P50549 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ETV1P50549 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ETV1P50549 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ETV1P50549 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ETV1P50549 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ETV1P50549 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ETV1P50549 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ETV1P50549 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ETV1P50549 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ETV1P50549 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ETV1P50549 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ETV1P50549 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ETV1P50549 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ETV1P50549 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ETV1P50549 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ETV1P50549 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ETV1P50549 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ETV1P50549 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ETV1P50549 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ETV1P50549 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ETV1P50549 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ETV1P50549 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms