Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms