Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 HIRA-204ENST00000464189 560 ntTSL 411.84□□□□□ -0.513e-7■■■■■ 146
UTP3Q9NQZ2 GPX4-202ENST00000585362 859 ntTSL 228.04■■■□□ 2.082e-13■■■■■ 146
UTP3Q9NQZ2 GPX4-211ENST00000614791 431 ntTSL 325.03■■□□□ 1.62e-13■■■■■ 146
UTP3Q9NQZ2 ABCF2-203ENST00000441774 941 ntTSL 321.53■■□□□ 1.048e-9■■■■■ 146
UTP3Q9NQZ2 ABCF2-204ENST00000468073 1031 ntTSL 211.14□□□□□ -0.638e-9■■■■■ 146
UTP3Q9NQZ2 ABCF2-202ENST00000287844 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.868e-9■■■■■ 146
UTP3Q9NQZ2 PCDH9-204ENST00000544246 6234 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.368e-7■■■■■ 145.9
UTP3Q9NQZ2 PCDH9-202ENST00000377865 5709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.858e-7■■■■■ 145.9
UTP3Q9NQZ2 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.518e-7■■■■■ 145.9
UTP3Q9NQZ2 ITGA2B-209ENST00000592462 3189 ntTSL 519.63■□□□□ 0.738e-7■■■■■ 145.9
UTP3Q9NQZ2 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.159e-11■■■■■ 145.9
UTP3Q9NQZ2 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.129e-11■■■■■ 145.9
UTP3Q9NQZ2 PASK-203ENST00000403638 5161 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.069e-11■■■■■ 145.9
UTP3Q9NQZ2 MED26-202ENST00000597244 3871 nt15.05■□□□□ -08e-7■■■■■ 145.9
UTP3Q9NQZ2 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.168e-7■■■■■ 145.9
UTP3Q9NQZ2 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.228e-7■■■■■ 145.9
UTP3Q9NQZ2 PASK-215ENST00000544142 4724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.279e-11■■■■■ 145.9
UTP3Q9NQZ2 PASK-202ENST00000358649 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.339e-11■■■■■ 145.9
UTP3Q9NQZ2 CASP3-206ENST00000523916 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.48e-7■■■■■ 145.9
UTP3Q9NQZ2 CASP3-201ENST00000308394 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.438e-7■■■■■ 145.9
UTP3Q9NQZ2 CASP3-202ENST00000393585 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.58e-7■■■■■ 145.9
UTP3Q9NQZ2 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC9.21□□□□□ -0.948e-7■■■■■ 145.9
UTP3Q9NQZ2 FARS2-204ENST00000602691 562 ntTSL 317.9■□□□□ 0.464e-6■■■■■ 145.8
UTP3Q9NQZ2 RTFDC1-204ENST00000449062 852 ntTSL 514.97□□□□□ -0.018e-7■■■■■ 145.8
UTP3Q9NQZ2 ODF2-203ENST00000372807 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.562e-8■■■■■ 145.8
UTP3Q9NQZ2 ODF2-210ENST00000444119 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.612e-8■■■■■ 145.8
UTP3Q9NQZ2 RNF144A-205ENST00000467276 900 ntTSL 327.81■■■□□ 2.042e-6■■■■■ 145.8
UTP3Q9NQZ2 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.062e-6■■■■■ 145.8
UTP3Q9NQZ2 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.396e-7■■■■■ 145.8
UTP3Q9NQZ2 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.026e-7■■■■■ 145.8
UTP3Q9NQZ2 CARS-202ENST00000380525 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.226e-7■■■■■ 145.8
UTP3Q9NQZ2 CARS-212ENST00000526890 5732 ntTSL 213.45□□□□□ -0.266e-7■■■■■ 145.8
UTP3Q9NQZ2 CARS-201ENST00000278224 2491 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.326e-7■■■■■ 145.8
UTP3Q9NQZ2 CARS-215ENST00000531387 2805 ntTSL 211.68□□□□□ -0.546e-7■■■■■ 145.8
UTP3Q9NQZ2 SMYD3-207ENST00000462422 971 ntTSL 513.67□□□□□ -0.221e-6■■■■■ 145.7
UTP3Q9NQZ2 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.655e-7■■■■■ 145.6
UTP3Q9NQZ2 PDE8A-210ENST00000559086 538 ntTSL 418.17■□□□□ 0.52e-7■■■■■ 145.6
UTP3Q9NQZ2 ZBTB38-209ENST00000509842 1434 ntTSL 1 (best)11.15□□□□□ -0.622e-8■■■■■ 145.6
UTP3Q9NQZ2 ZBTB38-203ENST00000503809 578 ntTSL 49.09□□□□□ -0.952e-8■■■■■ 145.6
UTP3Q9NQZ2 ZBTB38-217ENST00000513258 591 ntTSL 46.9□□□□□ -1.32e-8■■■■■ 145.6
UTP3Q9NQZ2 ZBTB38-207ENST00000507722 593 ntTSL 26.43□□□□□ -1.382e-8■■■■■ 145.6
UTP3Q9NQZ2 UBAP2-207ENST00000421278 833 ntTSL 58.31□□□□□ -1.081e-6■■■■■ 145.6
UTP3Q9NQZ2 UBAP2-206ENST00000412543 1349 ntTSL 57.5□□□□□ -1.211e-6■■■■■ 145.6
UTP3Q9NQZ2 SLC12A7-206ENST00000634447 3142 ntTSL 515.25■□□□□ 0.031e-8■■■■■ 145.4
UTP3Q9NQZ2 METTL14-201ENST00000388822 6669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.81e-8■■■■■ 145.4
UTP3Q9NQZ2 METTL14-206ENST00000628452 6625 ntTSL 58.63□□□□□ -1.031e-8■■■■■ 145.4
UTP3Q9NQZ2 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.112e-6■■■■■ 145.4
UTP3Q9NQZ2 TCOF1-215ENST00000515516 661 ntTSL 514.5□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 145.4
UTP3Q9NQZ2 TCOF1-203ENST00000394269 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.442e-6■■■■■ 145.4
UTP3Q9NQZ2 TCOF1-204ENST00000427724 4272 ntAPPRIS ALT2 TSL 512.11□□□□□ -0.472e-6■■■■■ 145.4
UTP3Q9NQZ2 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.686e-7■■■■■ 145.4
UTP3Q9NQZ2 AC092718.8-202ENST00000638192 610 ntTSL 519.64■□□□□ 0.739e-8■■■■■ 145.4
UTP3Q9NQZ2 AC092718.3-203ENST00000640370 2497 ntTSL 519.53■□□□□ 0.729e-8■■■■■ 145.4
UTP3Q9NQZ2 AC092718.3-201ENST00000638948 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 519.35■□□□□ 0.699e-8■■■■■ 145.4
UTP3Q9NQZ2 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.429e-8■■■■■ 145.4
UTP3Q9NQZ2 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.319e-8■■■■■ 145.4
UTP3Q9NQZ2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.253e-7■■■■■ 145.4
UTP3Q9NQZ2 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.593e-7■■■■■ 145.4
UTP3Q9NQZ2 ITGB1-202ENST00000396033 3784 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.35e-7■■■■■ 145.3
UTP3Q9NQZ2 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.315e-7■■■■■ 145.3
UTP3Q9NQZ2 CHMP4A-203ENST00000527154 571 ntTSL 217.16■□□□□ 0.341e-6■■■■■ 145.3
UTP3Q9NQZ2 CHMP4A-208ENST00000534106 370 ntTSL 54.44□□□□□ -1.71e-6■■■■■ 145.3
UTP3Q9NQZ2 PAK4-204ENST00000593480 714 ntTSL 321.11■□□□□ 0.972e-7■■■■■ 145.3
UTP3Q9NQZ2 PAK4-212ENST00000602004 564 ntTSL 419.72■□□□□ 0.752e-7■■■■■ 145.3
UTP3Q9NQZ2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.722e-7■■■■■ 145.3
UTP3Q9NQZ2 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.692e-7■■■■■ 145.3
UTP3Q9NQZ2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.582e-7■■■■■ 145.3
UTP3Q9NQZ2 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.512e-7■■■■■ 145.3
UTP3Q9NQZ2 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.272e-7■■■■■ 145.3
UTP3Q9NQZ2 OS9-210ENST00000549307 3870 ntTSL 210.14□□□□□ -0.793e-7■■■■■ 145.2
UTP3Q9NQZ2 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.18e-14■■■■■ 145.2
UTP3Q9NQZ2 FBXO34-203ENST00000554940 577 ntTSL 413.85□□□□□ -0.198e-14■■■■■ 145.2
UTP3Q9NQZ2 MYBBP1A-209ENST00000573723 613 ntTSL 512.99□□□□□ -0.331e-6■■■■■ 145.2
UTP3Q9NQZ2 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.291e-6■■■■■ 145.2
UTP3Q9NQZ2 CD81-217ENST00000533417 444 ntTSL 318.18■□□□□ 0.52e-6■■■■■ 145.1
UTP3Q9NQZ2 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.521e-6■■■■■ 145.1
UTP3Q9NQZ2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.81e-6■■■■■ 145
UTP3Q9NQZ2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.391e-6■■■■■ 145
UTP3Q9NQZ2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.131e-6■■■■■ 145
UTP3Q9NQZ2 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.471e-6■■■■■ 145
UTP3Q9NQZ2 TGIF1-221ENST00000552383 1267 ntTSL 217.77■□□□□ 0.441e-6■■■■■ 145
UTP3Q9NQZ2 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.091e-6■■■■■ 145
UTP3Q9NQZ2 TGIF1-209ENST00000546979 554 ntTSL 313.93□□□□□ -0.181e-6■■■■■ 145
UTP3Q9NQZ2 TGIF1-216ENST00000550958 706 ntTSL 39.99□□□□□ -0.811e-6■■■■■ 145
UTP3Q9NQZ2 TGIF1-211ENST00000548489 1536 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.91e-6■■■■■ 145
UTP3Q9NQZ2 TGIF1-223ENST00000618001 3030 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.961e-6■■■■■ 145
UTP3Q9NQZ2 TGIF1-215ENST00000549780 801 ntTSL 56.38□□□□□ -1.391e-6■■■■■ 145
UTP3Q9NQZ2 TGIF1-212ENST00000549253 563 ntTSL 35.51□□□□□ -1.531e-6■■■■■ 145
UTP3Q9NQZ2 CABIN1-203ENST00000398319 7480 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.121e-6■■■■■ 144.9
UTP3Q9NQZ2 CABIN1-201ENST00000263119 7222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.121e-6■■■■■ 144.9
UTP3Q9NQZ2 CABIN1-204ENST00000405822 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.161e-6■■■■■ 144.9
UTP3Q9NQZ2 CABIN1-214ENST00000617531 7072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.271e-6■■■■■ 144.9
UTP3Q9NQZ2 LINC01399-201ENST00000423311 648 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.851e-6■■■■■ 144.9
UTP3Q9NQZ2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.114e-8■■■■■ 144.9
UTP3Q9NQZ2 P3H1-209ENST00000462474 581 ntTSL 213.7□□□□□ -0.221e-6■■■■■ 144.8
UTP3Q9NQZ2 EYA3-202ENST00000373864 2459 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.253e-7■■■■■ 144.8
UTP3Q9NQZ2 EYA3-203ENST00000373871 6085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.713e-7■■■■■ 144.8
UTP3Q9NQZ2 EYA3-201ENST00000373863 1729 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.833e-7■■■■■ 144.8
UTP3Q9NQZ2 EYA3-208ENST00000540618 5885 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.973e-7■■■■■ 144.8
UTP3Q9NQZ2 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.143e-7■■■■■ 144.8
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 993.1 ms