Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms