Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC112Q8NEF3 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms