Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms