Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POU3F4P49335 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POU3F4P49335 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POU3F4P49335 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POU3F4P49335 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POU3F4P49335 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.05■□□□□ -0
POU3F4P49335 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
POU3F4P49335 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
POU3F4P49335 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
POU3F4P49335 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POU3F4P49335 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
POU3F4P49335 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
POU3F4P49335 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
POU3F4P49335 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.05■□□□□ -0
POU3F4P49335 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.05■□□□□ -0
POU3F4P49335 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POU3F4P49335 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POU3F4P49335 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.05■□□□□ -0
POU3F4P49335 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
POU3F4P49335 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POU3F4P49335 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POU3F4P49335 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
POU3F4P49335 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POU3F4P49335 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
POU3F4P49335 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
POU3F4P49335 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POU3F4P49335 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POU3F4P49335 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POU3F4P49335 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
POU3F4P49335 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POU3F4P49335 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POU3F4P49335 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POU3F4P49335 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
POU3F4P49335 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POU3F4P49335 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
POU3F4P49335 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POU3F4P49335 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POU3F4P49335 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
POU3F4P49335 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POU3F4P49335 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
POU3F4P49335 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
POU3F4P49335 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POU3F4P49335 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POU3F4P49335 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
POU3F4P49335 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
POU3F4P49335 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
POU3F4P49335 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POU3F4P49335 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
POU3F4P49335 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
POU3F4P49335 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
POU3F4P49335 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
POU3F4P49335 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
POU3F4P49335 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
POU3F4P49335 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
POU3F4P49335 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
POU3F4P49335 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
POU3F4P49335 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
POU3F4P49335 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
POU3F4P49335 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
POU3F4P49335 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POU3F4P49335 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.04■□□□□ -0
POU3F4P49335 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.04■□□□□ -0
POU3F4P49335 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
POU3F4P49335 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
POU3F4P49335 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
POU3F4P49335 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POU3F4P49335 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POU3F4P49335 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
POU3F4P49335 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
POU3F4P49335 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POU3F4P49335 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POU3F4P49335 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POU3F4P49335 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POU3F4P49335 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POU3F4P49335 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POU3F4P49335 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
POU3F4P49335 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POU3F4P49335 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POU3F4P49335 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POU3F4P49335 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
POU3F4P49335 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POU3F4P49335 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.03■□□□□ -0
POU3F4P49335 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POU3F4P49335 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
POU3F4P49335 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POU3F4P49335 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
POU3F4P49335 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POU3F4P49335 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POU3F4P49335 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POU3F4P49335 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
POU3F4P49335 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
POU3F4P49335 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POU3F4P49335 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
POU3F4P49335 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
POU3F4P49335 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POU3F4P49335 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
POU3F4P49335 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POU3F4P49335 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
POU3F4P49335 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
POU3F4P49335 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms