Protein–RNA interactions for Protein: P20333

TNFRSF1B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, humanhuman

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Length 461 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF1BP20333 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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TNFRSF1BP20333 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNFRSF1BP20333 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNFRSF1BP20333 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNFRSF1BP20333 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNFRSF1BP20333 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNFRSF1BP20333 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNFRSF1BP20333 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNFRSF1BP20333 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF1BP20333 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF1BP20333 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF1BP20333 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF1BP20333 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF1BP20333 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF1BP20333 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF1BP20333 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF1BP20333 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF1BP20333 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF1BP20333 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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TNFRSF1BP20333 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF1BP20333 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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TNFRSF1BP20333 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF1BP20333 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF1BP20333 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF1BP20333 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF1BP20333 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF1BP20333 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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TNFRSF1BP20333 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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TNFRSF1BP20333 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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TNFRSF1BP20333 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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TNFRSF1BP20333 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF1BP20333 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF1BP20333 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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TNFRSF1BP20333 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF1BP20333 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF1BP20333 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF1BP20333 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF1BP20333 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF1BP20333 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF1BP20333 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF1BP20333 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF1BP20333 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF1BP20333 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF1BP20333 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF1BP20333 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF1BP20333 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF1BP20333 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF1BP20333 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF1BP20333 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF1BP20333 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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