Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F3O00716 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F3O00716 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F3O00716 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F3O00716 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F3O00716 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F3O00716 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F3O00716 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F3O00716 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F3O00716 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F3O00716 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F3O00716 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F3O00716 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F3O00716 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F3O00716 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F3O00716 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F3O00716 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F3O00716 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F3O00716 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F3O00716 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F3O00716 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F3O00716 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F3O00716 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F3O00716 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F3O00716 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F3O00716 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F3O00716 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F3O00716 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F3O00716 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F3O00716 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F3O00716 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F3O00716 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F3O00716 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F3O00716 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F3O00716 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F3O00716 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F3O00716 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F3O00716 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F3O00716 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F3O00716 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F3O00716 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F3O00716 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F3O00716 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F3O00716 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F3O00716 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F3O00716 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F3O00716 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F3O00716 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F3O00716 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F3O00716 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F3O00716 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F3O00716 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F3O00716 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F3O00716 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F3O00716 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F3O00716 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F3O00716 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F3O00716 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F3O00716 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F3O00716 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F3O00716 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F3O00716 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F3O00716 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F3O00716 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F3O00716 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F3O00716 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F3O00716 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F3O00716 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F3O00716 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F3O00716 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F3O00716 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F3O00716 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F3O00716 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F3O00716 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F3O00716 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F3O00716 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F3O00716 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F3O00716 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F3O00716 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F3O00716 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F3O00716 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F3O00716 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F3O00716 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F3O00716 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F3O00716 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F3O00716 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F3O00716 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F3O00716 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F3O00716 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F3O00716 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F3O00716 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F3O00716 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F3O00716 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F3O00716 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F3O00716 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F3O00716 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F3O00716 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F3O00716 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F3O00716 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F3O00716 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms