Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms