Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms