Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
LRRN4Q8WUT4 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms