Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms