Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
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CHD4Q14839 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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CHD4Q14839 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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CHD4Q14839 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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CHD4Q14839 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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CHD4Q14839 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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CHD4Q14839 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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