Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms