Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCS1P62166 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCS1P62166 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCS1P62166 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCS1P62166 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCS1P62166 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCS1P62166 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCS1P62166 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCS1P62166 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCS1P62166 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCS1P62166 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCS1P62166 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCS1P62166 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCS1P62166 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCS1P62166 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCS1P62166 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCS1P62166 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCS1P62166 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCS1P62166 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCS1P62166 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCS1P62166 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCS1P62166 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCS1P62166 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCS1P62166 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCS1P62166 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCS1P62166 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCS1P62166 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCS1P62166 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCS1P62166 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCS1P62166 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCS1P62166 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCS1P62166 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCS1P62166 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCS1P62166 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCS1P62166 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCS1P62166 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCS1P62166 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCS1P62166 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCS1P62166 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCS1P62166 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCS1P62166 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCS1P62166 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCS1P62166 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NCS1P62166 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCS1P62166 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCS1P62166 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCS1P62166 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCS1P62166 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCS1P62166 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCS1P62166 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCS1P62166 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCS1P62166 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NCS1P62166 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCS1P62166 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NCS1P62166 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCS1P62166 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCS1P62166 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NCS1P62166 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NCS1P62166 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCS1P62166 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCS1P62166 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCS1P62166 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCS1P62166 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCS1P62166 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCS1P62166 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCS1P62166 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCS1P62166 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCS1P62166 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCS1P62166 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCS1P62166 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCS1P62166 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCS1P62166 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCS1P62166 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCS1P62166 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCS1P62166 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCS1P62166 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCS1P62166 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCS1P62166 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCS1P62166 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCS1P62166 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCS1P62166 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCS1P62166 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCS1P62166 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCS1P62166 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCS1P62166 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCS1P62166 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCS1P62166 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCS1P62166 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCS1P62166 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCS1P62166 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCS1P62166 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCS1P62166 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCS1P62166 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCS1P62166 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCS1P62166 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCS1P62166 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NCS1P62166 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCS1P62166 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCS1P62166 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCS1P62166 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms