Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms