Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms