Protein–RNA interactions for Protein: H7BZ55

CROCC2, Putative ciliary rootlet coiled-coil protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCC2H7BZ55 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CROCC2H7BZ55 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CROCC2H7BZ55 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CROCC2H7BZ55 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CROCC2H7BZ55 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CROCC2H7BZ55 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CROCC2H7BZ55 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CROCC2H7BZ55 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CROCC2H7BZ55 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CROCC2H7BZ55 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CROCC2H7BZ55 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CROCC2H7BZ55 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CROCC2H7BZ55 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CROCC2H7BZ55 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CROCC2H7BZ55 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CROCC2H7BZ55 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CROCC2H7BZ55 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CROCC2H7BZ55 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CROCC2H7BZ55 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CROCC2H7BZ55 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CROCC2H7BZ55 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CROCC2H7BZ55 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CROCC2H7BZ55 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CROCC2H7BZ55 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CROCC2H7BZ55 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CROCC2H7BZ55 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CROCC2H7BZ55 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CROCC2H7BZ55 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CROCC2H7BZ55 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CROCC2H7BZ55 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CROCC2H7BZ55 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CROCC2H7BZ55 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CROCC2H7BZ55 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CROCC2H7BZ55 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CROCC2H7BZ55 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CROCC2H7BZ55 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CROCC2H7BZ55 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms