Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFDP1Q9UEE9 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms