Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHG7

SVIP, Small VCP/p97-interacting protein, humanhuman

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Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVIPQ8NHG7 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 KLK2-202ENST00000358049 2847 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 AL353622.1-201ENST00000604716 1945 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 LRRTM4-204ENST00000409884 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 CARMN-205ENST00000518014 5131 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 TNIP1-218ENST00000523338 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 GRM8-201ENST00000339582 4057 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 AL512378.1-201ENST00000394808 2100 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 PCDHGA1-201ENST00000378105 4069 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 CHMP1B-201ENST00000526991 3054 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 INPP5J-208ENST00000412277 3512 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 CLDN19-201ENST00000296387 2859 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 CRYZ-205ENST00000417775 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 UBR4-201ENST00000375218 4031 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 SAMMSON-206ENST00000641053 1516 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 MASP2-201ENST00000400897 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 SLC12A4-204ENST00000541864 3627 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 DUSP4-202ENST00000240101 2959 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 C1S-203ENST00000402681 2522 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 LRRC37A7P-201ENST00000583900 2759 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 FCGR3A-204ENST00000436743 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 JAK3-207ENST00000534444 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 DIAPH2-203ENST00000373049 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 OSBPL6-206ENST00000409045 3427 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 RSPH10B2-203ENST00000404077 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 RSPH10B-202ENST00000404406 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 AC023136.1-201ENST00000513093 1105 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 TXNDC2-202ENST00000357775 2830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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