Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms