Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL3P10147 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL3P10147 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL3P10147 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL3P10147 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL3P10147 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL3P10147 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL3P10147 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL3P10147 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL3P10147 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL3P10147 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL3P10147 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL3P10147 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL3P10147 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL3P10147 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL3P10147 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL3P10147 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL3P10147 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL3P10147 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL3P10147 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL3P10147 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL3P10147 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL3P10147 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL3P10147 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL3P10147 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL3P10147 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL3P10147 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL3P10147 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL3P10147 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL3P10147 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3P10147 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3P10147 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3P10147 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3P10147 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3P10147 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3P10147 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3P10147 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3P10147 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3P10147 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3P10147 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3P10147 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3P10147 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3P10147 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3P10147 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3P10147 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3P10147 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3P10147 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3P10147 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3P10147 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3P10147 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3P10147 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3P10147 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3P10147 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3P10147 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3P10147 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3P10147 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3P10147 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3P10147 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3P10147 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3P10147 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3P10147 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3P10147 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3P10147 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3P10147 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3P10147 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3P10147 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3P10147 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3P10147 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3P10147 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3P10147 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3P10147 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3P10147 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3P10147 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3P10147 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3P10147 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3P10147 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3P10147 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3P10147 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3P10147 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3P10147 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3P10147 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3P10147 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3P10147 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3P10147 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3P10147 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3P10147 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3P10147 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3P10147 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3P10147 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3P10147 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3P10147 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3P10147 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3P10147 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3P10147 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3P10147 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3P10147 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3P10147 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3P10147 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3P10147 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3P10147 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms