Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms