Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC4A4Q9Y6R1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC4A4Q9Y6R1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC4A4Q9Y6R1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC4A4Q9Y6R1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC4A4Q9Y6R1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC4A4Q9Y6R1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC4A4Q9Y6R1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC4A4Q9Y6R1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SLC4A4Q9Y6R1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLC4A4Q9Y6R1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SLC4A4Q9Y6R1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SLC4A4Q9Y6R1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SLC4A4Q9Y6R1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC4A4Q9Y6R1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC4A4Q9Y6R1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC4A4Q9Y6R1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC4A4Q9Y6R1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC4A4Q9Y6R1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC4A4Q9Y6R1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC4A4Q9Y6R1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC4A4Q9Y6R1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC4A4Q9Y6R1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC4A4Q9Y6R1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC4A4Q9Y6R1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC4A4Q9Y6R1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC4A4Q9Y6R1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC4A4Q9Y6R1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC4A4Q9Y6R1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC4A4Q9Y6R1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC4A4Q9Y6R1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC4A4Q9Y6R1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC4A4Q9Y6R1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SLC4A4Q9Y6R1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SLC4A4Q9Y6R1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC4A4Q9Y6R1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC4A4Q9Y6R1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC4A4Q9Y6R1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC4A4Q9Y6R1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC4A4Q9Y6R1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC4A4Q9Y6R1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC4A4Q9Y6R1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC4A4Q9Y6R1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC4A4Q9Y6R1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC4A4Q9Y6R1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC4A4Q9Y6R1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC4A4Q9Y6R1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC4A4Q9Y6R1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC4A4Q9Y6R1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC4A4Q9Y6R1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC4A4Q9Y6R1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC4A4Q9Y6R1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC4A4Q9Y6R1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC4A4Q9Y6R1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC4A4Q9Y6R1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC4A4Q9Y6R1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC4A4Q9Y6R1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC4A4Q9Y6R1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC4A4Q9Y6R1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC4A4Q9Y6R1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC4A4Q9Y6R1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC4A4Q9Y6R1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC4A4Q9Y6R1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC4A4Q9Y6R1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC4A4Q9Y6R1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SLC4A4Q9Y6R1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC4A4Q9Y6R1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC4A4Q9Y6R1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC4A4Q9Y6R1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC4A4Q9Y6R1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC4A4Q9Y6R1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC4A4Q9Y6R1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC4A4Q9Y6R1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC4A4Q9Y6R1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC4A4Q9Y6R1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC4A4Q9Y6R1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC4A4Q9Y6R1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC4A4Q9Y6R1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC4A4Q9Y6R1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC4A4Q9Y6R1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC4A4Q9Y6R1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC4A4Q9Y6R1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC4A4Q9Y6R1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC4A4Q9Y6R1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC4A4Q9Y6R1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC4A4Q9Y6R1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC4A4Q9Y6R1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC4A4Q9Y6R1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC4A4Q9Y6R1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.2
SLC4A4Q9Y6R1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC4A4Q9Y6R1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC4A4Q9Y6R1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC4A4Q9Y6R1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC4A4Q9Y6R1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC4A4Q9Y6R1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC4A4Q9Y6R1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms