Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X0

SNX10, Sorting nexin-10, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10Q9Y5X0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX10Q9Y5X0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX10Q9Y5X0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX10Q9Y5X0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX10Q9Y5X0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX10Q9Y5X0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX10Q9Y5X0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX10Q9Y5X0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX10Q9Y5X0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX10Q9Y5X0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX10Q9Y5X0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX10Q9Y5X0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX10Q9Y5X0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX10Q9Y5X0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX10Q9Y5X0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX10Q9Y5X0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SNX10Q9Y5X0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX10Q9Y5X0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX10Q9Y5X0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX10Q9Y5X0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX10Q9Y5X0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX10Q9Y5X0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX10Q9Y5X0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX10Q9Y5X0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX10Q9Y5X0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX10Q9Y5X0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX10Q9Y5X0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX10Q9Y5X0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX10Q9Y5X0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX10Q9Y5X0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX10Q9Y5X0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX10Q9Y5X0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX10Q9Y5X0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX10Q9Y5X0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX10Q9Y5X0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX10Q9Y5X0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX10Q9Y5X0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX10Q9Y5X0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX10Q9Y5X0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX10Q9Y5X0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX10Q9Y5X0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX10Q9Y5X0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX10Q9Y5X0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX10Q9Y5X0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX10Q9Y5X0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX10Q9Y5X0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX10Q9Y5X0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX10Q9Y5X0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX10Q9Y5X0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX10Q9Y5X0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX10Q9Y5X0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX10Q9Y5X0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX10Q9Y5X0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX10Q9Y5X0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX10Q9Y5X0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX10Q9Y5X0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX10Q9Y5X0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX10Q9Y5X0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX10Q9Y5X0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX10Q9Y5X0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SNX10Q9Y5X0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SNX10Q9Y5X0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SNX10Q9Y5X0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX10Q9Y5X0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX10Q9Y5X0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX10Q9Y5X0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX10Q9Y5X0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX10Q9Y5X0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX10Q9Y5X0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX10Q9Y5X0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX10Q9Y5X0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX10Q9Y5X0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX10Q9Y5X0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX10Q9Y5X0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX10Q9Y5X0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX10Q9Y5X0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX10Q9Y5X0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX10Q9Y5X0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX10Q9Y5X0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX10Q9Y5X0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX10Q9Y5X0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX10Q9Y5X0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SNX10Q9Y5X0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX10Q9Y5X0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX10Q9Y5X0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX10Q9Y5X0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX10Q9Y5X0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX10Q9Y5X0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX10Q9Y5X0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX10Q9Y5X0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX10Q9Y5X0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX10Q9Y5X0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX10Q9Y5X0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX10Q9Y5X0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX10Q9Y5X0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX10Q9Y5X0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX10Q9Y5X0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX10Q9Y5X0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX10Q9Y5X0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX10Q9Y5X0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms