Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNIP3Q9Y2W7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNIP3Q9Y2W7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNIP3Q9Y2W7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNIP3Q9Y2W7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNIP3Q9Y2W7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNIP3Q9Y2W7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNIP3Q9Y2W7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNIP3Q9Y2W7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNIP3Q9Y2W7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNIP3Q9Y2W7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNIP3Q9Y2W7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNIP3Q9Y2W7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNIP3Q9Y2W7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNIP3Q9Y2W7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNIP3Q9Y2W7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNIP3Q9Y2W7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNIP3Q9Y2W7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNIP3Q9Y2W7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNIP3Q9Y2W7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNIP3Q9Y2W7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNIP3Q9Y2W7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNIP3Q9Y2W7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNIP3Q9Y2W7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNIP3Q9Y2W7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNIP3Q9Y2W7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KCNIP3Q9Y2W7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KCNIP3Q9Y2W7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNIP3Q9Y2W7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNIP3Q9Y2W7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNIP3Q9Y2W7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNIP3Q9Y2W7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNIP3Q9Y2W7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNIP3Q9Y2W7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNIP3Q9Y2W7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNIP3Q9Y2W7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNIP3Q9Y2W7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNIP3Q9Y2W7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNIP3Q9Y2W7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNIP3Q9Y2W7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNIP3Q9Y2W7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNIP3Q9Y2W7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNIP3Q9Y2W7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNIP3Q9Y2W7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNIP3Q9Y2W7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNIP3Q9Y2W7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNIP3Q9Y2W7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNIP3Q9Y2W7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNIP3Q9Y2W7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNIP3Q9Y2W7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNIP3Q9Y2W7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNIP3Q9Y2W7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNIP3Q9Y2W7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNIP3Q9Y2W7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNIP3Q9Y2W7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNIP3Q9Y2W7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNIP3Q9Y2W7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNIP3Q9Y2W7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNIP3Q9Y2W7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNIP3Q9Y2W7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNIP3Q9Y2W7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNIP3Q9Y2W7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNIP3Q9Y2W7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNIP3Q9Y2W7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNIP3Q9Y2W7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNIP3Q9Y2W7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNIP3Q9Y2W7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNIP3Q9Y2W7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNIP3Q9Y2W7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNIP3Q9Y2W7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNIP3Q9Y2W7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNIP3Q9Y2W7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNIP3Q9Y2W7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNIP3Q9Y2W7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNIP3Q9Y2W7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNIP3Q9Y2W7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNIP3Q9Y2W7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNIP3Q9Y2W7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNIP3Q9Y2W7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNIP3Q9Y2W7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNIP3Q9Y2W7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNIP3Q9Y2W7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNIP3Q9Y2W7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNIP3Q9Y2W7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNIP3Q9Y2W7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNIP3Q9Y2W7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNIP3Q9Y2W7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNIP3Q9Y2W7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNIP3Q9Y2W7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNIP3Q9Y2W7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms