Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I7

PIKFYVE, 1-phosphatidylinositol 3-phosphate 5-kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIKFYVEQ9Y2I7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIKFYVEQ9Y2I7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIKFYVEQ9Y2I7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIKFYVEQ9Y2I7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIKFYVEQ9Y2I7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIKFYVEQ9Y2I7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIKFYVEQ9Y2I7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIKFYVEQ9Y2I7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIKFYVEQ9Y2I7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PIKFYVEQ9Y2I7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PIKFYVEQ9Y2I7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIKFYVEQ9Y2I7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIKFYVEQ9Y2I7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PIKFYVEQ9Y2I7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PIKFYVEQ9Y2I7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PIKFYVEQ9Y2I7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PIKFYVEQ9Y2I7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PIKFYVEQ9Y2I7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PIKFYVEQ9Y2I7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIKFYVEQ9Y2I7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PIKFYVEQ9Y2I7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIKFYVEQ9Y2I7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIKFYVEQ9Y2I7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIKFYVEQ9Y2I7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIKFYVEQ9Y2I7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIKFYVEQ9Y2I7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PIKFYVEQ9Y2I7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIKFYVEQ9Y2I7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIKFYVEQ9Y2I7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIKFYVEQ9Y2I7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIKFYVEQ9Y2I7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIKFYVEQ9Y2I7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIKFYVEQ9Y2I7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIKFYVEQ9Y2I7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIKFYVEQ9Y2I7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIKFYVEQ9Y2I7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIKFYVEQ9Y2I7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIKFYVEQ9Y2I7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PIKFYVEQ9Y2I7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIKFYVEQ9Y2I7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIKFYVEQ9Y2I7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIKFYVEQ9Y2I7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIKFYVEQ9Y2I7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIKFYVEQ9Y2I7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIKFYVEQ9Y2I7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIKFYVEQ9Y2I7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIKFYVEQ9Y2I7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIKFYVEQ9Y2I7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIKFYVEQ9Y2I7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIKFYVEQ9Y2I7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIKFYVEQ9Y2I7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIKFYVEQ9Y2I7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIKFYVEQ9Y2I7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PIKFYVEQ9Y2I7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PIKFYVEQ9Y2I7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PIKFYVEQ9Y2I7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PIKFYVEQ9Y2I7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PIKFYVEQ9Y2I7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PIKFYVEQ9Y2I7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PIKFYVEQ9Y2I7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PIKFYVEQ9Y2I7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PIKFYVEQ9Y2I7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PIKFYVEQ9Y2I7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PIKFYVEQ9Y2I7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PIKFYVEQ9Y2I7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PIKFYVEQ9Y2I7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PIKFYVEQ9Y2I7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PIKFYVEQ9Y2I7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PIKFYVEQ9Y2I7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PIKFYVEQ9Y2I7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PIKFYVEQ9Y2I7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PIKFYVEQ9Y2I7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PIKFYVEQ9Y2I7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PIKFYVEQ9Y2I7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PIKFYVEQ9Y2I7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PIKFYVEQ9Y2I7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PIKFYVEQ9Y2I7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PIKFYVEQ9Y2I7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PIKFYVEQ9Y2I7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PIKFYVEQ9Y2I7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PIKFYVEQ9Y2I7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PIKFYVEQ9Y2I7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PIKFYVEQ9Y2I7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PIKFYVEQ9Y2I7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PIKFYVEQ9Y2I7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PIKFYVEQ9Y2I7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PIKFYVEQ9Y2I7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
PIKFYVEQ9Y2I7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PIKFYVEQ9Y2I7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PIKFYVEQ9Y2I7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PIKFYVEQ9Y2I7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PIKFYVEQ9Y2I7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PIKFYVEQ9Y2I7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PIKFYVEQ9Y2I7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PIKFYVEQ9Y2I7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PIKFYVEQ9Y2I7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PIKFYVEQ9Y2I7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms