Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC4Q9Y296 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC4Q9Y296 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC4Q9Y296 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC4Q9Y296 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC4Q9Y296 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC4Q9Y296 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC4Q9Y296 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC4Q9Y296 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC4Q9Y296 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC4Q9Y296 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC4Q9Y296 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC4Q9Y296 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC4Q9Y296 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC4Q9Y296 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC4Q9Y296 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC4Q9Y296 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC4Q9Y296 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC4Q9Y296 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC4Q9Y296 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC4Q9Y296 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC4Q9Y296 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC4Q9Y296 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC4Q9Y296 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC4Q9Y296 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC4Q9Y296 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC4Q9Y296 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC4Q9Y296 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC4Q9Y296 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC4Q9Y296 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC4Q9Y296 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC4Q9Y296 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC4Q9Y296 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC4Q9Y296 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC4Q9Y296 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC4Q9Y296 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC4Q9Y296 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC4Q9Y296 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC4Q9Y296 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC4Q9Y296 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC4Q9Y296 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC4Q9Y296 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC4Q9Y296 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC4Q9Y296 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC4Q9Y296 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC4Q9Y296 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC4Q9Y296 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC4Q9Y296 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC4Q9Y296 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC4Q9Y296 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC4Q9Y296 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC4Q9Y296 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC4Q9Y296 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC4Q9Y296 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC4Q9Y296 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC4Q9Y296 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC4Q9Y296 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC4Q9Y296 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC4Q9Y296 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC4Q9Y296 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC4Q9Y296 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC4Q9Y296 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC4Q9Y296 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC4Q9Y296 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC4Q9Y296 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC4Q9Y296 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC4Q9Y296 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC4Q9Y296 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC4Q9Y296 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC4Q9Y296 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC4Q9Y296 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC4Q9Y296 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC4Q9Y296 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC4Q9Y296 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC4Q9Y296 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC4Q9Y296 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC4Q9Y296 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC4Q9Y296 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC4Q9Y296 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC4Q9Y296 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC4Q9Y296 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC4Q9Y296 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAPPC4Q9Y296 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAPPC4Q9Y296 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRAPPC4Q9Y296 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAPPC4Q9Y296 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC4Q9Y296 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC4Q9Y296 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC4Q9Y296 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC4Q9Y296 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC4Q9Y296 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC4Q9Y296 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC4Q9Y296 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC4Q9Y296 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC4Q9Y296 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC4Q9Y296 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC4Q9Y296 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC4Q9Y296 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC4Q9Y296 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms