Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX7Q9UNH6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX7Q9UNH6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX7Q9UNH6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX7Q9UNH6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX7Q9UNH6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX7Q9UNH6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX7Q9UNH6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX7Q9UNH6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX7Q9UNH6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX7Q9UNH6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX7Q9UNH6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX7Q9UNH6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX7Q9UNH6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX7Q9UNH6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX7Q9UNH6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX7Q9UNH6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX7Q9UNH6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX7Q9UNH6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX7Q9UNH6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX7Q9UNH6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX7Q9UNH6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX7Q9UNH6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX7Q9UNH6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX7Q9UNH6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX7Q9UNH6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX7Q9UNH6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX7Q9UNH6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX7Q9UNH6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX7Q9UNH6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX7Q9UNH6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX7Q9UNH6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX7Q9UNH6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX7Q9UNH6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX7Q9UNH6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX7Q9UNH6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX7Q9UNH6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX7Q9UNH6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX7Q9UNH6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX7Q9UNH6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX7Q9UNH6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX7Q9UNH6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX7Q9UNH6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX7Q9UNH6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX7Q9UNH6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX7Q9UNH6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNX7Q9UNH6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNX7Q9UNH6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNX7Q9UNH6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX7Q9UNH6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX7Q9UNH6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX7Q9UNH6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX7Q9UNH6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX7Q9UNH6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX7Q9UNH6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX7Q9UNH6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX7Q9UNH6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX7Q9UNH6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX7Q9UNH6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX7Q9UNH6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX7Q9UNH6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX7Q9UNH6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX7Q9UNH6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX7Q9UNH6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX7Q9UNH6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX7Q9UNH6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX7Q9UNH6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX7Q9UNH6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX7Q9UNH6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX7Q9UNH6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX7Q9UNH6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX7Q9UNH6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX7Q9UNH6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX7Q9UNH6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX7Q9UNH6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX7Q9UNH6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX7Q9UNH6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX7Q9UNH6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX7Q9UNH6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX7Q9UNH6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX7Q9UNH6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX7Q9UNH6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX7Q9UNH6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX7Q9UNH6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX7Q9UNH6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX7Q9UNH6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX7Q9UNH6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX7Q9UNH6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX7Q9UNH6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX7Q9UNH6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX7Q9UNH6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX7Q9UNH6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX7Q9UNH6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SNX7Q9UNH6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX7Q9UNH6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX7Q9UNH6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX7Q9UNH6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX7Q9UNH6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX7Q9UNH6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX7Q9UNH6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms