Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZNRF3Q9ULT6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ZNRF3Q9ULT6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ZNRF3Q9ULT6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ZNRF3Q9ULT6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ZNRF3Q9ULT6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
ZNRF3Q9ULT6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZNRF3Q9ULT6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZNRF3Q9ULT6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZNRF3Q9ULT6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZNRF3Q9ULT6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZNRF3Q9ULT6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZNRF3Q9ULT6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZNRF3Q9ULT6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZNRF3Q9ULT6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZNRF3Q9ULT6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ZNRF3Q9ULT6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ZNRF3Q9ULT6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ZNRF3Q9ULT6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ZNRF3Q9ULT6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
ZNRF3Q9ULT6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ZNRF3Q9ULT6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ZNRF3Q9ULT6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ZNRF3Q9ULT6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
ZNRF3Q9ULT6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
ZNRF3Q9ULT6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ZNRF3Q9ULT6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZNRF3Q9ULT6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZNRF3Q9ULT6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZNRF3Q9ULT6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZNRF3Q9ULT6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZNRF3Q9ULT6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZNRF3Q9ULT6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZNRF3Q9ULT6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZNRF3Q9ULT6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZNRF3Q9ULT6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZNRF3Q9ULT6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZNRF3Q9ULT6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZNRF3Q9ULT6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZNRF3Q9ULT6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZNRF3Q9ULT6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZNRF3Q9ULT6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZNRF3Q9ULT6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZNRF3Q9ULT6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZNRF3Q9ULT6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZNRF3Q9ULT6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZNRF3Q9ULT6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
ZNRF3Q9ULT6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZNRF3Q9ULT6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
ZNRF3Q9ULT6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZNRF3Q9ULT6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZNRF3Q9ULT6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZNRF3Q9ULT6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNRF3Q9ULT6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNRF3Q9ULT6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNRF3Q9ULT6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNRF3Q9ULT6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNRF3Q9ULT6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZNRF3Q9ULT6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZNRF3Q9ULT6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZNRF3Q9ULT6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZNRF3Q9ULT6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZNRF3Q9ULT6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZNRF3Q9ULT6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZNRF3Q9ULT6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZNRF3Q9ULT6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZNRF3Q9ULT6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZNRF3Q9ULT6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZNRF3Q9ULT6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZNRF3Q9ULT6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZNRF3Q9ULT6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
ZNRF3Q9ULT6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
ZNRF3Q9ULT6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZNRF3Q9ULT6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZNRF3Q9ULT6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
ZNRF3Q9ULT6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZNRF3Q9ULT6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZNRF3Q9ULT6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZNRF3Q9ULT6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZNRF3Q9ULT6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZNRF3Q9ULT6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZNRF3Q9ULT6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZNRF3Q9ULT6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZNRF3Q9ULT6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNRF3Q9ULT6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNRF3Q9ULT6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNRF3Q9ULT6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNRF3Q9ULT6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNRF3Q9ULT6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNRF3Q9ULT6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNRF3Q9ULT6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNRF3Q9ULT6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNRF3Q9ULT6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNRF3Q9ULT6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNRF3Q9ULT6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNRF3Q9ULT6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNRF3Q9ULT6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZNRF3Q9ULT6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms