Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PADI1Q9ULC6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PADI1Q9ULC6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PADI1Q9ULC6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PADI1Q9ULC6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PADI1Q9ULC6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PADI1Q9ULC6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PADI1Q9ULC6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PADI1Q9ULC6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PADI1Q9ULC6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PADI1Q9ULC6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PADI1Q9ULC6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PADI1Q9ULC6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PADI1Q9ULC6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PADI1Q9ULC6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PADI1Q9ULC6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PADI1Q9ULC6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PADI1Q9ULC6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PADI1Q9ULC6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PADI1Q9ULC6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PADI1Q9ULC6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PADI1Q9ULC6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PADI1Q9ULC6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PADI1Q9ULC6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PADI1Q9ULC6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PADI1Q9ULC6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PADI1Q9ULC6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PADI1Q9ULC6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PADI1Q9ULC6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PADI1Q9ULC6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PADI1Q9ULC6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PADI1Q9ULC6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PADI1Q9ULC6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PADI1Q9ULC6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PADI1Q9ULC6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PADI1Q9ULC6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PADI1Q9ULC6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PADI1Q9ULC6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PADI1Q9ULC6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PADI1Q9ULC6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PADI1Q9ULC6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PADI1Q9ULC6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PADI1Q9ULC6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PADI1Q9ULC6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PADI1Q9ULC6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PADI1Q9ULC6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PADI1Q9ULC6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PADI1Q9ULC6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PADI1Q9ULC6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PADI1Q9ULC6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PADI1Q9ULC6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PADI1Q9ULC6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PADI1Q9ULC6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PADI1Q9ULC6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PADI1Q9ULC6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PADI1Q9ULC6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PADI1Q9ULC6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PADI1Q9ULC6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PADI1Q9ULC6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PADI1Q9ULC6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PADI1Q9ULC6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PADI1Q9ULC6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PADI1Q9ULC6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PADI1Q9ULC6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PADI1Q9ULC6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PADI1Q9ULC6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PADI1Q9ULC6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PADI1Q9ULC6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PADI1Q9ULC6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PADI1Q9ULC6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PADI1Q9ULC6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PADI1Q9ULC6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PADI1Q9ULC6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PADI1Q9ULC6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PADI1Q9ULC6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PADI1Q9ULC6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PADI1Q9ULC6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PADI1Q9ULC6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PADI1Q9ULC6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PADI1Q9ULC6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PADI1Q9ULC6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PADI1Q9ULC6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PADI1Q9ULC6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PADI1Q9ULC6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PADI1Q9ULC6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PADI1Q9ULC6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PADI1Q9ULC6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PADI1Q9ULC6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PADI1Q9ULC6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PADI1Q9ULC6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PADI1Q9ULC6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PADI1Q9ULC6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PADI1Q9ULC6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PADI1Q9ULC6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PADI1Q9ULC6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PADI1Q9ULC6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PADI1Q9ULC6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PADI1Q9ULC6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PADI1Q9ULC6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PADI1Q9ULC6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms