Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPREB3Q9UKI3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPREB3Q9UKI3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
VPREB3Q9UKI3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
VPREB3Q9UKI3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPREB3Q9UKI3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPREB3Q9UKI3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPREB3Q9UKI3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VPREB3Q9UKI3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VPREB3Q9UKI3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
VPREB3Q9UKI3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
VPREB3Q9UKI3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VPREB3Q9UKI3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VPREB3Q9UKI3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VPREB3Q9UKI3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VPREB3Q9UKI3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VPREB3Q9UKI3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VPREB3Q9UKI3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VPREB3Q9UKI3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VPREB3Q9UKI3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VPREB3Q9UKI3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VPREB3Q9UKI3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VPREB3Q9UKI3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPREB3Q9UKI3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPREB3Q9UKI3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPREB3Q9UKI3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPREB3Q9UKI3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPREB3Q9UKI3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPREB3Q9UKI3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPREB3Q9UKI3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPREB3Q9UKI3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPREB3Q9UKI3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPREB3Q9UKI3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
VPREB3Q9UKI3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPREB3Q9UKI3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPREB3Q9UKI3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPREB3Q9UKI3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPREB3Q9UKI3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPREB3Q9UKI3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPREB3Q9UKI3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPREB3Q9UKI3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPREB3Q9UKI3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPREB3Q9UKI3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPREB3Q9UKI3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPREB3Q9UKI3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPREB3Q9UKI3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPREB3Q9UKI3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPREB3Q9UKI3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPREB3Q9UKI3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VPREB3Q9UKI3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VPREB3Q9UKI3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VPREB3Q9UKI3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VPREB3Q9UKI3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VPREB3Q9UKI3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPREB3Q9UKI3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPREB3Q9UKI3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPREB3Q9UKI3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPREB3Q9UKI3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPREB3Q9UKI3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPREB3Q9UKI3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPREB3Q9UKI3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
VPREB3Q9UKI3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
VPREB3Q9UKI3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPREB3Q9UKI3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPREB3Q9UKI3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPREB3Q9UKI3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPREB3Q9UKI3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
VPREB3Q9UKI3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPREB3Q9UKI3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPREB3Q9UKI3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPREB3Q9UKI3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPREB3Q9UKI3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPREB3Q9UKI3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPREB3Q9UKI3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPREB3Q9UKI3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPREB3Q9UKI3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPREB3Q9UKI3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPREB3Q9UKI3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
VPREB3Q9UKI3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPREB3Q9UKI3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPREB3Q9UKI3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPREB3Q9UKI3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VPREB3Q9UKI3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VPREB3Q9UKI3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VPREB3Q9UKI3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VPREB3Q9UKI3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VPREB3Q9UKI3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VPREB3Q9UKI3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VPREB3Q9UKI3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VPREB3Q9UKI3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VPREB3Q9UKI3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VPREB3Q9UKI3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VPREB3Q9UKI3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VPREB3Q9UKI3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VPREB3Q9UKI3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VPREB3Q9UKI3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VPREB3Q9UKI3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VPREB3Q9UKI3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VPREB3Q9UKI3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VPREB3Q9UKI3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.9 ms