Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT1

TUBD1, Tubulin delta chain, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBD1Q9UJT1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBD1Q9UJT1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBD1Q9UJT1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBD1Q9UJT1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBD1Q9UJT1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBD1Q9UJT1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TUBD1Q9UJT1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBD1Q9UJT1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBD1Q9UJT1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBD1Q9UJT1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBD1Q9UJT1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBD1Q9UJT1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBD1Q9UJT1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBD1Q9UJT1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBD1Q9UJT1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBD1Q9UJT1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBD1Q9UJT1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBD1Q9UJT1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBD1Q9UJT1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBD1Q9UJT1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBD1Q9UJT1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBD1Q9UJT1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBD1Q9UJT1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBD1Q9UJT1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBD1Q9UJT1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBD1Q9UJT1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBD1Q9UJT1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBD1Q9UJT1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBD1Q9UJT1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBD1Q9UJT1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBD1Q9UJT1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBD1Q9UJT1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBD1Q9UJT1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBD1Q9UJT1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBD1Q9UJT1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBD1Q9UJT1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBD1Q9UJT1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBD1Q9UJT1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBD1Q9UJT1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBD1Q9UJT1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUBD1Q9UJT1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
TUBD1Q9UJT1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBD1Q9UJT1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBD1Q9UJT1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBD1Q9UJT1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBD1Q9UJT1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBD1Q9UJT1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBD1Q9UJT1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBD1Q9UJT1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBD1Q9UJT1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBD1Q9UJT1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBD1Q9UJT1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBD1Q9UJT1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBD1Q9UJT1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBD1Q9UJT1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBD1Q9UJT1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBD1Q9UJT1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBD1Q9UJT1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBD1Q9UJT1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBD1Q9UJT1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBD1Q9UJT1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBD1Q9UJT1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBD1Q9UJT1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBD1Q9UJT1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBD1Q9UJT1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBD1Q9UJT1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBD1Q9UJT1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBD1Q9UJT1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBD1Q9UJT1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBD1Q9UJT1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBD1Q9UJT1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBD1Q9UJT1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBD1Q9UJT1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBD1Q9UJT1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBD1Q9UJT1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBD1Q9UJT1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBD1Q9UJT1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBD1Q9UJT1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBD1Q9UJT1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBD1Q9UJT1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TUBD1Q9UJT1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TUBD1Q9UJT1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TUBD1Q9UJT1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TUBD1Q9UJT1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TUBD1Q9UJT1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBD1Q9UJT1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBD1Q9UJT1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBD1Q9UJT1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBD1Q9UJT1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBD1Q9UJT1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBD1Q9UJT1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBD1Q9UJT1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBD1Q9UJT1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBD1Q9UJT1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBD1Q9UJT1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBD1Q9UJT1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBD1Q9UJT1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBD1Q9UJT1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBD1Q9UJT1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBD1Q9UJT1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms