Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ94

LINC00527, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00527, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00527Q9UJ94 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00527Q9UJ94 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00527Q9UJ94 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00527Q9UJ94 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00527Q9UJ94 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00527Q9UJ94 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00527Q9UJ94 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00527Q9UJ94 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00527Q9UJ94 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00527Q9UJ94 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00527Q9UJ94 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00527Q9UJ94 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00527Q9UJ94 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00527Q9UJ94 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00527Q9UJ94 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00527Q9UJ94 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00527Q9UJ94 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00527Q9UJ94 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00527Q9UJ94 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00527Q9UJ94 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00527Q9UJ94 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00527Q9UJ94 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00527Q9UJ94 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00527Q9UJ94 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00527Q9UJ94 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00527Q9UJ94 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00527Q9UJ94 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00527Q9UJ94 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00527Q9UJ94 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00527Q9UJ94 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00527Q9UJ94 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00527Q9UJ94 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00527Q9UJ94 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00527Q9UJ94 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00527Q9UJ94 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00527Q9UJ94 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00527Q9UJ94 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00527Q9UJ94 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00527Q9UJ94 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00527Q9UJ94 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00527Q9UJ94 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00527Q9UJ94 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00527Q9UJ94 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00527Q9UJ94 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00527Q9UJ94 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00527Q9UJ94 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LINC00527Q9UJ94 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LINC00527Q9UJ94 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LINC00527Q9UJ94 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00527Q9UJ94 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00527Q9UJ94 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00527Q9UJ94 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00527Q9UJ94 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00527Q9UJ94 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00527Q9UJ94 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00527Q9UJ94 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00527Q9UJ94 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00527Q9UJ94 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00527Q9UJ94 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00527Q9UJ94 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00527Q9UJ94 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00527Q9UJ94 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00527Q9UJ94 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00527Q9UJ94 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00527Q9UJ94 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00527Q9UJ94 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00527Q9UJ94 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00527Q9UJ94 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00527Q9UJ94 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00527Q9UJ94 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00527Q9UJ94 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00527Q9UJ94 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00527Q9UJ94 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00527Q9UJ94 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00527Q9UJ94 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00527Q9UJ94 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00527Q9UJ94 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00527Q9UJ94 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00527Q9UJ94 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00527Q9UJ94 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00527Q9UJ94 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00527Q9UJ94 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00527Q9UJ94 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00527Q9UJ94 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00527Q9UJ94 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00527Q9UJ94 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00527Q9UJ94 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00527Q9UJ94 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00527Q9UJ94 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00527Q9UJ94 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00527Q9UJ94 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00527Q9UJ94 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00527Q9UJ94 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00527Q9UJ94 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00527Q9UJ94 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00527Q9UJ94 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00527Q9UJ94 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00527Q9UJ94 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00527Q9UJ94 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00527Q9UJ94 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms