Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MBD1Q9UIS9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MBD1Q9UIS9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MBD1Q9UIS9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MBD1Q9UIS9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MBD1Q9UIS9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MBD1Q9UIS9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MBD1Q9UIS9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MBD1Q9UIS9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MBD1Q9UIS9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MBD1Q9UIS9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MBD1Q9UIS9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MBD1Q9UIS9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MBD1Q9UIS9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MBD1Q9UIS9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MBD1Q9UIS9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MBD1Q9UIS9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MBD1Q9UIS9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MBD1Q9UIS9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MBD1Q9UIS9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MBD1Q9UIS9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MBD1Q9UIS9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MBD1Q9UIS9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MBD1Q9UIS9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MBD1Q9UIS9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MBD1Q9UIS9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MBD1Q9UIS9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MBD1Q9UIS9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MBD1Q9UIS9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MBD1Q9UIS9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MBD1Q9UIS9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MBD1Q9UIS9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MBD1Q9UIS9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MBD1Q9UIS9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MBD1Q9UIS9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MBD1Q9UIS9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MBD1Q9UIS9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MBD1Q9UIS9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MBD1Q9UIS9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MBD1Q9UIS9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MBD1Q9UIS9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MBD1Q9UIS9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MBD1Q9UIS9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MBD1Q9UIS9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MBD1Q9UIS9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MBD1Q9UIS9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MBD1Q9UIS9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MBD1Q9UIS9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MBD1Q9UIS9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MBD1Q9UIS9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MBD1Q9UIS9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MBD1Q9UIS9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MBD1Q9UIS9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MBD1Q9UIS9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MBD1Q9UIS9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MBD1Q9UIS9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MBD1Q9UIS9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MBD1Q9UIS9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MBD1Q9UIS9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MBD1Q9UIS9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MBD1Q9UIS9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MBD1Q9UIS9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MBD1Q9UIS9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MBD1Q9UIS9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MBD1Q9UIS9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MBD1Q9UIS9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MBD1Q9UIS9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MBD1Q9UIS9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MBD1Q9UIS9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MBD1Q9UIS9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MBD1Q9UIS9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MBD1Q9UIS9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MBD1Q9UIS9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MBD1Q9UIS9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MBD1Q9UIS9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MBD1Q9UIS9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MBD1Q9UIS9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MBD1Q9UIS9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MBD1Q9UIS9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MBD1Q9UIS9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MBD1Q9UIS9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MBD1Q9UIS9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MBD1Q9UIS9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MBD1Q9UIS9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MBD1Q9UIS9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MBD1Q9UIS9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MBD1Q9UIS9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MBD1Q9UIS9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MBD1Q9UIS9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MBD1Q9UIS9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MBD1Q9UIS9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MBD1Q9UIS9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MBD1Q9UIS9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MBD1Q9UIS9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MBD1Q9UIS9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MBD1Q9UIS9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MBD1Q9UIS9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MBD1Q9UIS9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MBD1Q9UIS9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MBD1Q9UIS9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms