Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPASTQ9UBP0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPASTQ9UBP0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPASTQ9UBP0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPASTQ9UBP0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPASTQ9UBP0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPASTQ9UBP0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPASTQ9UBP0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPASTQ9UBP0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPASTQ9UBP0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPASTQ9UBP0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPASTQ9UBP0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPASTQ9UBP0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPASTQ9UBP0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPASTQ9UBP0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPASTQ9UBP0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPASTQ9UBP0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPASTQ9UBP0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPASTQ9UBP0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SPASTQ9UBP0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPASTQ9UBP0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPASTQ9UBP0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPASTQ9UBP0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SPASTQ9UBP0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPASTQ9UBP0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPASTQ9UBP0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPASTQ9UBP0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPASTQ9UBP0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPASTQ9UBP0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPASTQ9UBP0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPASTQ9UBP0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPASTQ9UBP0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPASTQ9UBP0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPASTQ9UBP0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPASTQ9UBP0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPASTQ9UBP0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPASTQ9UBP0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPASTQ9UBP0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPASTQ9UBP0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPASTQ9UBP0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPASTQ9UBP0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPASTQ9UBP0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPASTQ9UBP0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPASTQ9UBP0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SPASTQ9UBP0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPASTQ9UBP0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPASTQ9UBP0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SPASTQ9UBP0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPASTQ9UBP0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPASTQ9UBP0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPASTQ9UBP0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPASTQ9UBP0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPASTQ9UBP0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPASTQ9UBP0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPASTQ9UBP0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SPASTQ9UBP0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPASTQ9UBP0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPASTQ9UBP0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPASTQ9UBP0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPASTQ9UBP0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPASTQ9UBP0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPASTQ9UBP0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPASTQ9UBP0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPASTQ9UBP0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPASTQ9UBP0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPASTQ9UBP0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPASTQ9UBP0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPASTQ9UBP0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPASTQ9UBP0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPASTQ9UBP0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPASTQ9UBP0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPASTQ9UBP0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPASTQ9UBP0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SPASTQ9UBP0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPASTQ9UBP0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPASTQ9UBP0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPASTQ9UBP0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPASTQ9UBP0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPASTQ9UBP0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPASTQ9UBP0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPASTQ9UBP0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPASTQ9UBP0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPASTQ9UBP0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPASTQ9UBP0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPASTQ9UBP0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPASTQ9UBP0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPASTQ9UBP0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SPASTQ9UBP0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPASTQ9UBP0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPASTQ9UBP0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPASTQ9UBP0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPASTQ9UBP0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPASTQ9UBP0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPASTQ9UBP0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPASTQ9UBP0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPASTQ9UBP0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPASTQ9UBP0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPASTQ9UBP0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SPASTQ9UBP0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPASTQ9UBP0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms