Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2Q2

FRMD4A, FERM domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,039 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD4AQ9P2Q2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FRMD4AQ9P2Q2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FRMD4AQ9P2Q2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FRMD4AQ9P2Q2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FRMD4AQ9P2Q2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FRMD4AQ9P2Q2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
FRMD4AQ9P2Q2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FRMD4AQ9P2Q2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FRMD4AQ9P2Q2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FRMD4AQ9P2Q2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
FRMD4AQ9P2Q2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FRMD4AQ9P2Q2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FRMD4AQ9P2Q2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FRMD4AQ9P2Q2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FRMD4AQ9P2Q2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FRMD4AQ9P2Q2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FRMD4AQ9P2Q2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FRMD4AQ9P2Q2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FRMD4AQ9P2Q2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FRMD4AQ9P2Q2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FRMD4AQ9P2Q2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FRMD4AQ9P2Q2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FRMD4AQ9P2Q2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FRMD4AQ9P2Q2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FRMD4AQ9P2Q2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FRMD4AQ9P2Q2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FRMD4AQ9P2Q2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FRMD4AQ9P2Q2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FRMD4AQ9P2Q2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FRMD4AQ9P2Q2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FRMD4AQ9P2Q2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FRMD4AQ9P2Q2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FRMD4AQ9P2Q2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
FRMD4AQ9P2Q2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FRMD4AQ9P2Q2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FRMD4AQ9P2Q2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FRMD4AQ9P2Q2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FRMD4AQ9P2Q2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FRMD4AQ9P2Q2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FRMD4AQ9P2Q2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FRMD4AQ9P2Q2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FRMD4AQ9P2Q2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FRMD4AQ9P2Q2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FRMD4AQ9P2Q2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FRMD4AQ9P2Q2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
FRMD4AQ9P2Q2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FRMD4AQ9P2Q2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FRMD4AQ9P2Q2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FRMD4AQ9P2Q2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FRMD4AQ9P2Q2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FRMD4AQ9P2Q2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FRMD4AQ9P2Q2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FRMD4AQ9P2Q2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FRMD4AQ9P2Q2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
FRMD4AQ9P2Q2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
FRMD4AQ9P2Q2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
FRMD4AQ9P2Q2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FRMD4AQ9P2Q2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FRMD4AQ9P2Q2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FRMD4AQ9P2Q2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FRMD4AQ9P2Q2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FRMD4AQ9P2Q2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FRMD4AQ9P2Q2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FRMD4AQ9P2Q2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FRMD4AQ9P2Q2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FRMD4AQ9P2Q2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FRMD4AQ9P2Q2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FRMD4AQ9P2Q2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
FRMD4AQ9P2Q2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FRMD4AQ9P2Q2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FRMD4AQ9P2Q2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FRMD4AQ9P2Q2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FRMD4AQ9P2Q2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FRMD4AQ9P2Q2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FRMD4AQ9P2Q2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FRMD4AQ9P2Q2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FRMD4AQ9P2Q2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FRMD4AQ9P2Q2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FRMD4AQ9P2Q2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FRMD4AQ9P2Q2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FRMD4AQ9P2Q2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FRMD4AQ9P2Q2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FRMD4AQ9P2Q2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FRMD4AQ9P2Q2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FRMD4AQ9P2Q2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FRMD4AQ9P2Q2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
FRMD4AQ9P2Q2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FRMD4AQ9P2Q2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FRMD4AQ9P2Q2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FRMD4AQ9P2Q2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FRMD4AQ9P2Q2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FRMD4AQ9P2Q2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
FRMD4AQ9P2Q2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FRMD4AQ9P2Q2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FRMD4AQ9P2Q2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FRMD4AQ9P2Q2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FRMD4AQ9P2Q2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FRMD4AQ9P2Q2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FRMD4AQ9P2Q2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FRMD4AQ9P2Q2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms