Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUS5

AP5S1, AP-5 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5S1Q9NUS5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP5S1Q9NUS5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP5S1Q9NUS5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP5S1Q9NUS5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP5S1Q9NUS5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP5S1Q9NUS5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP5S1Q9NUS5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP5S1Q9NUS5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP5S1Q9NUS5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP5S1Q9NUS5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP5S1Q9NUS5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP5S1Q9NUS5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP5S1Q9NUS5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AP5S1Q9NUS5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AP5S1Q9NUS5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AP5S1Q9NUS5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AP5S1Q9NUS5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AP5S1Q9NUS5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AP5S1Q9NUS5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AP5S1Q9NUS5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AP5S1Q9NUS5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AP5S1Q9NUS5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AP5S1Q9NUS5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
AP5S1Q9NUS5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AP5S1Q9NUS5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AP5S1Q9NUS5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AP5S1Q9NUS5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AP5S1Q9NUS5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AP5S1Q9NUS5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AP5S1Q9NUS5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AP5S1Q9NUS5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AP5S1Q9NUS5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AP5S1Q9NUS5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AP5S1Q9NUS5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AP5S1Q9NUS5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP5S1Q9NUS5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP5S1Q9NUS5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP5S1Q9NUS5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP5S1Q9NUS5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP5S1Q9NUS5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP5S1Q9NUS5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP5S1Q9NUS5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP5S1Q9NUS5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP5S1Q9NUS5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP5S1Q9NUS5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP5S1Q9NUS5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP5S1Q9NUS5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP5S1Q9NUS5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP5S1Q9NUS5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP5S1Q9NUS5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP5S1Q9NUS5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP5S1Q9NUS5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AP5S1Q9NUS5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AP5S1Q9NUS5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
AP5S1Q9NUS5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AP5S1Q9NUS5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AP5S1Q9NUS5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AP5S1Q9NUS5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AP5S1Q9NUS5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AP5S1Q9NUS5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AP5S1Q9NUS5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AP5S1Q9NUS5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
AP5S1Q9NUS5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AP5S1Q9NUS5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AP5S1Q9NUS5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
AP5S1Q9NUS5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
AP5S1Q9NUS5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
AP5S1Q9NUS5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AP5S1Q9NUS5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
AP5S1Q9NUS5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
AP5S1Q9NUS5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
AP5S1Q9NUS5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AP5S1Q9NUS5 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
AP5S1Q9NUS5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AP5S1Q9NUS5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AP5S1Q9NUS5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
AP5S1Q9NUS5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP5S1Q9NUS5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP5S1Q9NUS5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP5S1Q9NUS5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP5S1Q9NUS5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP5S1Q9NUS5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP5S1Q9NUS5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
AP5S1Q9NUS5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AP5S1Q9NUS5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AP5S1Q9NUS5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AP5S1Q9NUS5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AP5S1Q9NUS5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
AP5S1Q9NUS5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AP5S1Q9NUS5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
AP5S1Q9NUS5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AP5S1Q9NUS5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP5S1Q9NUS5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP5S1Q9NUS5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP5S1Q9NUS5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP5S1Q9NUS5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP5S1Q9NUS5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP5S1Q9NUS5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP5S1Q9NUS5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP5S1Q9NUS5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms