Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTM9

CUTC, Copper homeostasis protein cutC homolog, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUTCQ9NTM9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CUTCQ9NTM9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CUTCQ9NTM9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CUTCQ9NTM9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CUTCQ9NTM9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CUTCQ9NTM9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CUTCQ9NTM9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CUTCQ9NTM9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CUTCQ9NTM9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CUTCQ9NTM9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CUTCQ9NTM9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CUTCQ9NTM9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CUTCQ9NTM9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CUTCQ9NTM9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CUTCQ9NTM9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CUTCQ9NTM9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CUTCQ9NTM9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CUTCQ9NTM9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CUTCQ9NTM9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CUTCQ9NTM9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CUTCQ9NTM9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CUTCQ9NTM9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CUTCQ9NTM9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CUTCQ9NTM9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CUTCQ9NTM9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CUTCQ9NTM9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CUTCQ9NTM9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CUTCQ9NTM9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CUTCQ9NTM9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CUTCQ9NTM9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CUTCQ9NTM9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CUTCQ9NTM9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CUTCQ9NTM9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CUTCQ9NTM9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CUTCQ9NTM9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUTCQ9NTM9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUTCQ9NTM9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUTCQ9NTM9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUTCQ9NTM9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUTCQ9NTM9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUTCQ9NTM9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUTCQ9NTM9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUTCQ9NTM9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUTCQ9NTM9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUTCQ9NTM9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CUTCQ9NTM9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CUTCQ9NTM9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CUTCQ9NTM9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CUTCQ9NTM9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CUTCQ9NTM9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CUTCQ9NTM9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CUTCQ9NTM9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUTCQ9NTM9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUTCQ9NTM9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUTCQ9NTM9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUTCQ9NTM9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUTCQ9NTM9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUTCQ9NTM9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUTCQ9NTM9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUTCQ9NTM9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUTCQ9NTM9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUTCQ9NTM9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUTCQ9NTM9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CUTCQ9NTM9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUTCQ9NTM9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUTCQ9NTM9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUTCQ9NTM9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUTCQ9NTM9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUTCQ9NTM9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CUTCQ9NTM9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CUTCQ9NTM9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CUTCQ9NTM9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CUTCQ9NTM9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CUTCQ9NTM9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CUTCQ9NTM9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CUTCQ9NTM9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUTCQ9NTM9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUTCQ9NTM9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUTCQ9NTM9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUTCQ9NTM9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUTCQ9NTM9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUTCQ9NTM9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUTCQ9NTM9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUTCQ9NTM9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CUTCQ9NTM9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CUTCQ9NTM9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CUTCQ9NTM9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CUTCQ9NTM9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUTCQ9NTM9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUTCQ9NTM9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUTCQ9NTM9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUTCQ9NTM9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUTCQ9NTM9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUTCQ9NTM9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUTCQ9NTM9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUTCQ9NTM9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUTCQ9NTM9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUTCQ9NTM9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUTCQ9NTM9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUTCQ9NTM9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms