Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX4

PHPT1, 14 kDa phosphohistidine phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHPT1Q9NRX4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHPT1Q9NRX4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHPT1Q9NRX4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHPT1Q9NRX4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHPT1Q9NRX4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHPT1Q9NRX4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHPT1Q9NRX4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHPT1Q9NRX4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHPT1Q9NRX4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHPT1Q9NRX4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PHPT1Q9NRX4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHPT1Q9NRX4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHPT1Q9NRX4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHPT1Q9NRX4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHPT1Q9NRX4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHPT1Q9NRX4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHPT1Q9NRX4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHPT1Q9NRX4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHPT1Q9NRX4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHPT1Q9NRX4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHPT1Q9NRX4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHPT1Q9NRX4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHPT1Q9NRX4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHPT1Q9NRX4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PHPT1Q9NRX4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHPT1Q9NRX4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHPT1Q9NRX4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHPT1Q9NRX4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHPT1Q9NRX4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHPT1Q9NRX4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHPT1Q9NRX4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHPT1Q9NRX4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHPT1Q9NRX4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHPT1Q9NRX4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHPT1Q9NRX4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHPT1Q9NRX4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHPT1Q9NRX4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHPT1Q9NRX4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHPT1Q9NRX4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHPT1Q9NRX4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PHPT1Q9NRX4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHPT1Q9NRX4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHPT1Q9NRX4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PHPT1Q9NRX4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PHPT1Q9NRX4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PHPT1Q9NRX4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHPT1Q9NRX4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHPT1Q9NRX4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHPT1Q9NRX4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHPT1Q9NRX4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHPT1Q9NRX4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHPT1Q9NRX4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHPT1Q9NRX4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHPT1Q9NRX4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHPT1Q9NRX4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHPT1Q9NRX4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHPT1Q9NRX4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHPT1Q9NRX4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHPT1Q9NRX4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PHPT1Q9NRX4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHPT1Q9NRX4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHPT1Q9NRX4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHPT1Q9NRX4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHPT1Q9NRX4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHPT1Q9NRX4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHPT1Q9NRX4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHPT1Q9NRX4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHPT1Q9NRX4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHPT1Q9NRX4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHPT1Q9NRX4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PHPT1Q9NRX4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHPT1Q9NRX4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHPT1Q9NRX4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHPT1Q9NRX4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PHPT1Q9NRX4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PHPT1Q9NRX4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHPT1Q9NRX4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHPT1Q9NRX4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHPT1Q9NRX4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHPT1Q9NRX4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHPT1Q9NRX4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHPT1Q9NRX4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHPT1Q9NRX4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHPT1Q9NRX4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHPT1Q9NRX4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHPT1Q9NRX4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHPT1Q9NRX4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHPT1Q9NRX4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHPT1Q9NRX4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PHPT1Q9NRX4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PHPT1Q9NRX4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHPT1Q9NRX4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHPT1Q9NRX4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHPT1Q9NRX4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHPT1Q9NRX4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHPT1Q9NRX4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHPT1Q9NRX4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHPT1Q9NRX4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHPT1Q9NRX4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHPT1Q9NRX4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms