Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR4

NIT2, Omega-amidase NIT2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIT2Q9NQR4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIT2Q9NQR4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIT2Q9NQR4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIT2Q9NQR4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIT2Q9NQR4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIT2Q9NQR4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIT2Q9NQR4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIT2Q9NQR4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIT2Q9NQR4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIT2Q9NQR4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIT2Q9NQR4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NIT2Q9NQR4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIT2Q9NQR4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIT2Q9NQR4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIT2Q9NQR4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIT2Q9NQR4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIT2Q9NQR4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIT2Q9NQR4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIT2Q9NQR4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIT2Q9NQR4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIT2Q9NQR4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIT2Q9NQR4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIT2Q9NQR4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIT2Q9NQR4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIT2Q9NQR4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIT2Q9NQR4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIT2Q9NQR4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIT2Q9NQR4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIT2Q9NQR4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIT2Q9NQR4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIT2Q9NQR4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIT2Q9NQR4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIT2Q9NQR4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIT2Q9NQR4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIT2Q9NQR4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIT2Q9NQR4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIT2Q9NQR4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIT2Q9NQR4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIT2Q9NQR4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIT2Q9NQR4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIT2Q9NQR4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NIT2Q9NQR4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NIT2Q9NQR4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIT2Q9NQR4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIT2Q9NQR4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIT2Q9NQR4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIT2Q9NQR4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIT2Q9NQR4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NIT2Q9NQR4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIT2Q9NQR4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIT2Q9NQR4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NIT2Q9NQR4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIT2Q9NQR4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIT2Q9NQR4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIT2Q9NQR4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIT2Q9NQR4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIT2Q9NQR4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIT2Q9NQR4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIT2Q9NQR4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIT2Q9NQR4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIT2Q9NQR4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIT2Q9NQR4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIT2Q9NQR4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIT2Q9NQR4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIT2Q9NQR4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIT2Q9NQR4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIT2Q9NQR4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIT2Q9NQR4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIT2Q9NQR4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIT2Q9NQR4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIT2Q9NQR4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIT2Q9NQR4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIT2Q9NQR4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIT2Q9NQR4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIT2Q9NQR4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIT2Q9NQR4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIT2Q9NQR4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIT2Q9NQR4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIT2Q9NQR4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIT2Q9NQR4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIT2Q9NQR4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIT2Q9NQR4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIT2Q9NQR4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIT2Q9NQR4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIT2Q9NQR4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIT2Q9NQR4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NIT2Q9NQR4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NIT2Q9NQR4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIT2Q9NQR4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIT2Q9NQR4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIT2Q9NQR4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIT2Q9NQR4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIT2Q9NQR4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIT2Q9NQR4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NIT2Q9NQR4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NIT2Q9NQR4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIT2Q9NQR4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIT2Q9NQR4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIT2Q9NQR4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIT2Q9NQR4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms