Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPY3

CD93, Complement component C1q receptor, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD93Q9NPY3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD93Q9NPY3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD93Q9NPY3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD93Q9NPY3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD93Q9NPY3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD93Q9NPY3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD93Q9NPY3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CD93Q9NPY3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CD93Q9NPY3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CD93Q9NPY3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD93Q9NPY3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CD93Q9NPY3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD93Q9NPY3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD93Q9NPY3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD93Q9NPY3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD93Q9NPY3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD93Q9NPY3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD93Q9NPY3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD93Q9NPY3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CD93Q9NPY3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD93Q9NPY3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD93Q9NPY3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD93Q9NPY3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD93Q9NPY3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD93Q9NPY3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD93Q9NPY3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD93Q9NPY3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CD93Q9NPY3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD93Q9NPY3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD93Q9NPY3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD93Q9NPY3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD93Q9NPY3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD93Q9NPY3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD93Q9NPY3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD93Q9NPY3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD93Q9NPY3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD93Q9NPY3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD93Q9NPY3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD93Q9NPY3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD93Q9NPY3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD93Q9NPY3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD93Q9NPY3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD93Q9NPY3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD93Q9NPY3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD93Q9NPY3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD93Q9NPY3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CD93Q9NPY3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD93Q9NPY3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD93Q9NPY3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD93Q9NPY3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD93Q9NPY3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD93Q9NPY3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CD93Q9NPY3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD93Q9NPY3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD93Q9NPY3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD93Q9NPY3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD93Q9NPY3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CD93Q9NPY3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CD93Q9NPY3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD93Q9NPY3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD93Q9NPY3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD93Q9NPY3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD93Q9NPY3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD93Q9NPY3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD93Q9NPY3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD93Q9NPY3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD93Q9NPY3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD93Q9NPY3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD93Q9NPY3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD93Q9NPY3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD93Q9NPY3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD93Q9NPY3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD93Q9NPY3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD93Q9NPY3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD93Q9NPY3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD93Q9NPY3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD93Q9NPY3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD93Q9NPY3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CD93Q9NPY3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD93Q9NPY3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD93Q9NPY3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD93Q9NPY3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD93Q9NPY3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD93Q9NPY3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD93Q9NPY3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CD93Q9NPY3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD93Q9NPY3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD93Q9NPY3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD93Q9NPY3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD93Q9NPY3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD93Q9NPY3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD93Q9NPY3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD93Q9NPY3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD93Q9NPY3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD93Q9NPY3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD93Q9NPY3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD93Q9NPY3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD93Q9NPY3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CD93Q9NPY3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD93Q9NPY3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms