Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPJ6

MED4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED4Q9NPJ6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MED4Q9NPJ6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MED4Q9NPJ6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MED4Q9NPJ6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MED4Q9NPJ6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MED4Q9NPJ6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MED4Q9NPJ6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MED4Q9NPJ6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MED4Q9NPJ6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MED4Q9NPJ6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MED4Q9NPJ6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MED4Q9NPJ6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MED4Q9NPJ6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MED4Q9NPJ6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MED4Q9NPJ6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MED4Q9NPJ6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MED4Q9NPJ6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MED4Q9NPJ6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MED4Q9NPJ6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MED4Q9NPJ6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MED4Q9NPJ6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MED4Q9NPJ6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MED4Q9NPJ6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MED4Q9NPJ6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MED4Q9NPJ6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MED4Q9NPJ6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MED4Q9NPJ6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MED4Q9NPJ6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MED4Q9NPJ6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MED4Q9NPJ6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MED4Q9NPJ6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MED4Q9NPJ6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MED4Q9NPJ6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MED4Q9NPJ6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MED4Q9NPJ6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MED4Q9NPJ6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MED4Q9NPJ6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MED4Q9NPJ6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MED4Q9NPJ6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MED4Q9NPJ6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MED4Q9NPJ6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MED4Q9NPJ6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MED4Q9NPJ6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MED4Q9NPJ6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MED4Q9NPJ6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MED4Q9NPJ6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MED4Q9NPJ6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MED4Q9NPJ6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MED4Q9NPJ6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MED4Q9NPJ6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MED4Q9NPJ6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MED4Q9NPJ6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MED4Q9NPJ6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MED4Q9NPJ6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MED4Q9NPJ6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MED4Q9NPJ6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MED4Q9NPJ6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MED4Q9NPJ6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MED4Q9NPJ6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MED4Q9NPJ6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MED4Q9NPJ6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MED4Q9NPJ6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MED4Q9NPJ6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MED4Q9NPJ6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MED4Q9NPJ6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MED4Q9NPJ6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MED4Q9NPJ6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MED4Q9NPJ6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MED4Q9NPJ6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MED4Q9NPJ6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MED4Q9NPJ6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MED4Q9NPJ6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MED4Q9NPJ6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MED4Q9NPJ6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MED4Q9NPJ6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MED4Q9NPJ6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MED4Q9NPJ6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MED4Q9NPJ6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MED4Q9NPJ6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MED4Q9NPJ6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MED4Q9NPJ6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MED4Q9NPJ6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MED4Q9NPJ6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MED4Q9NPJ6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MED4Q9NPJ6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MED4Q9NPJ6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MED4Q9NPJ6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MED4Q9NPJ6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MED4Q9NPJ6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MED4Q9NPJ6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MED4Q9NPJ6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MED4Q9NPJ6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MED4Q9NPJ6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MED4Q9NPJ6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MED4Q9NPJ6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MED4Q9NPJ6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MED4Q9NPJ6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MED4Q9NPJ6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MED4Q9NPJ6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MED4Q9NPJ6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms